Por defecto el listado de directorios en Lighttpd está desactivado, de esa forma, si abrimos una url y no tenemos ningún index.php, index.html o el que esté estipulado en la configuración, nos devuelve un 404.
Para activarlo, en general,
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# server.dir-listing = "enable"
# /etc/init.d/httpd restart
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